MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187074	TAT	2	6	99	104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187074	TA	3	6	107	112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187074	ACTC	2	8	228	235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187074	ATT	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187074	TA	3	6	271	276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187074	ATG	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187074	ATC	2	6	308	313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187074	TAAA	2	8	321	328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187074	CAT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187074	ATT	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187074	T	6	6	358	363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187074	CTGAC	2	10	414	423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NT_187074	A	6	6	460	465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187074	A	6	6	480	485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187074	T	6	6	491	496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187074	AAC	2	6	497	502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187074	ATTT	2	8	538	545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187074	T	6	6	597	602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187074	GCT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187074	ATAC	2	8	695	702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187074	CAAC	2	8	770	777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187074	CAT	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187074	A	7	7	786	792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187074	GCC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187074	AC	3	6	4921	4926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187074	TA	3	6	4942	4947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187074	A	6	6	4947	4952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187074	TTA	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187074	TTGTT	2	10	5115	5124	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187074	C	6	6	5573	5578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NT_187074	CAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187074	CAA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187074	A	6	6	5836	5841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187074	ATATCA	2	12	5845	5856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NT_187074	GAC	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187074	TGG	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187074	GGC	2	6	6274	6279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187074	GCC	2	6	6305	6310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NT_187074	GGC	2	6	6315	6320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187074	CAAC	2	8	8258	8265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187074	ATA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187074	GAAAG	2	10	8305	8314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187074	CT	3	6	8487	8492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187074	TC	4	8	9647	9654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187074	GAT	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187074	TTA	2	6	9729	9734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187074	TCA	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187074	A	7	7	9757	9763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187074	A	6	6	9777	9782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187074	GAT	2	6	9811	9816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187074	CTGA	2	8	9822	9829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NT_187074	A	6	6	11743	11748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187074	AAAG	2	8	11794	11801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187074	TC	3	6	11853	11858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NT_187074	GGC	2	6	12230	12235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187074	TA	3	6	12301	12306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187074	AATA	2	8	12314	12321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187074	TA	3	6	12320	12325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187074	TAC	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187074	GAT	2	6	12366	12371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187074	AAAAT	2	10	12416	12425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187074	TGTT	2	8	12477	12484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187074	ATA	2	6	12538	12543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187074	CTT	2	6	12613	12618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187074	TTA	2	6	12636	12641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187074	GT	3	6	13777	13782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187074	ATC	2	6	13804	13809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187074	T	6	6	13811	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187074	GAA	2	6	15946	15951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187074	GCGTT	2	10	18840	18849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NT_187074	CAC	2	6	18898	18903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NT_187074	ATT	2	6	18932	18937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187074	CA	3	6	19048	19053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NT_187074	GATT	2	8	19072	19079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187074	ACT	2	6	19085	19090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187074	TAT	2	6	19123	19128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187074	A	6	6	19155	19160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187074	CCAT	2	8	19166	19173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187074	CA	3	6	19262	19267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NT_187074	CTCATT	2	12	19315	19326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187074	AATGT	2	10	19336	19345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187074	GCA	2	6	19378	19383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187074	ATT	2	6	19438	19443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187074	TCT	2	6	19507	19512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187074	TTTC	2	8	19516	19523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NT_187074	TGAAA	2	10	19620	19629	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187074	TA	3	6	19648	19653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187074	ATA	2	6	19668	19673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187074	GCT	2	6	19851	19856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187074	AAT	2	6	19881	19886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187074	ATG	2	6	19899	19904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187074	ATA	4	12	19906	19917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187074	GAG	2	6	19971	19976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187074	CAA	2	6	25468	25473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187074	GGA	2	6	26135	26140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187074	CCT	2	6	26189	26194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187074	AAAC	2	8	26216	26223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NT_187074	TC	3	6	26332	26337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NT_187074	ATAG	2	8	26347	26354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187074	ATA	2	6	26423	26428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187074	T	6	6	26491	26496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187074	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187074	T	6	6	26668	26673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187074	ATA	2	6	26681	26686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187074	GTC	2	6	26688	26693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187074	ATG	2	6	26697	26702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187074	TAA	2	6	27936	27941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187074	TCA	2	6	27982	27987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187074	TC	3	6	28144	28149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NT_187074	AAGG	2	8	28209	28216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187074	A	7	7	29829	29835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187074	AT	3	6	29848	29853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187074	GAA	2	6	29876	29881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187074	TGT	2	6	31122	31127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187074	AAT	2	6	31186	31191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187074	T	6	6	31225	31230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187074	GATGC	2	10	31286	31295	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NT_187074	TAA	2	6	31331	31336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187074	A	6	6	31335	31340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187074	AT	3	6	31380	31385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187074	TAA	2	6	31420	31425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187074	TG	3	6	31458	31463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187074	TA	3	6	31489	31494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187074	ATA	2	6	32082	32087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187074	GCT	2	6	32092	32097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187074	TGA	2	6	32173	32178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187074	A	6	6	32828	32833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187074	GA	3	6	32852	32857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187074	CTA	2	6	32875	32880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187074	TGC	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187074	A	6	6	32920	32925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187074	AG	3	6	32940	32945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187074	A	6	6	32953	32958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187074	CAT	2	6	32993	32998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187074	TTC	2	6	33010	33015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187074	TTA	2	6	33083	33088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187074	AT	3	6	33493	33498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187074	GC	5	10	33508	33517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NT_187074	CG	4	8	33529	33536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NT_187074	CAT	2	6	39562	39567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187074	GTC	2	6	39681	39686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NT_187074	CA	3	6	42510	42515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NT_187074	CGCTT	2	10	42774	42783	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NT_187074	TAA	2	6	42844	42849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187074	TA	3	6	42890	42895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187074	GAC	2	6	42945	42950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NT_187074	CGC	2	6	42969	42974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NT_187074	T	6	6	42992	42997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187074	C	6	6	44311	44316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NT_187074	AAC	2	6	44340	44345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NT_187074	ATG	2	6	44354	44359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NT_187074	ATC	2	6	44385	44390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NT_187074	T	6	6	44397	44402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187074	ATTG	2	8	44414	44421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187074	TGAA	2	8	49404	49411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187074	GCC	2	6	49449	49454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NT_187074	AGCG	2	8	49459	49466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NT_187074	CCCGT	2	10	49494	49503	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
159	NT_187074	T	7	7	49599	49605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NT_187074	CGTTT	2	10	49821	49830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NT_187074	TA	4	8	49871	49878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NT_187074	GGGA	2	8	49882	49889	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
163	NT_187074	A	6	6	52314	52319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NT_187074	ATGG	2	8	52337	52344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NT_187074	CTG	2	6	52371	52376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NT_187074	CTGA	2	8	52430	52437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NT_187074	C	6	6	52440	52445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
168	NT_187074	TC	3	6	52459	52464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NT_187074	ATT	2	6	52547	52552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NT_187074	CTA	2	6	53672	53677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NT_187074	T	6	6	53704	53709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187074	TAA	2	6	53766	53771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NT_187074	CTCTT	2	10	56578	56587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NT_187074	TTA	2	6	56611	56616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NT_187074	GAT	2	6	56629	56634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NT_187074	GTT	2	6	56673	56678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NT_187074	ACT	2	6	56723	56728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NT_187074	GAT	2	6	56769	56774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NT_187074	TAA	3	9	56779	56787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NT_187074	CAT	2	6	57087	57092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NT_187074	CGG	2	6	57114	57119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
182	NT_187074	TATT	2	8	57123	57130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NT_187074	T	6	6	58867	58872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NT_187074	TTTTC	2	10	58944	58953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NT_187074	CTTTG	2	10	59051	59060	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NT_187074	GCC	2	6	60015	60020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
187	NT_187074	AAT	2	6	60085	60090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NT_187074	TTA	2	6	61280	61285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NT_187074	G	6	6	64746	64751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
190	NT_187074	GC	3	6	64773	64778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
191	NT_187074	GCAG	2	8	65816	65823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
192	NT_187074	GCG	2	6	65867	65872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
193	NT_187074	CTT	2	6	65886	65891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NT_187074	TA	3	6	65893	65898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NT_187074	GTT	2	6	65952	65957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NT_187074	ATT	2	6	66002	66007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NT_187074	T	8	8	66058	66065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NT_187074	TTA	2	6	66118	66123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NT_187074	AAT	2	6	66165	66170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NT_187074	CGC	2	6	66189	66194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
201	NT_187074	CTT	2	6	66201	66206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
202	NT_187074	GAG	2	6	66267	66272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
203	NT_187074	CTA	2	6	66361	66366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
204	NT_187074	TTA	2	6	66383	66388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NT_187074	ACC	2	6	66399	66404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
206	NT_187074	ACA	3	9	66481	66489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
207	NT_187074	TAC	2	6	66549	66554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
208	NT_187074	ACA	2	6	66726	66731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
209	NT_187074	ATG	2	6	66736	66741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
210	NT_187074	TGA	3	9	66779	66787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
211	NT_187074	AAC	2	6	66999	67004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
212	NT_187074	CGA	2	6	67085	67090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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217	NT_187074	TGA	2	6	67316	67321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.